| 順位 | 選手名 | 所属名 | レーン | タイム | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 小 原 英 志 | 帝京第三高校教員 | IN | 04:06.49 | |
| 2 | 平 野 将 紀 | 山梨学院大学 | OUT | 04:07.96 | |
| 3 | 新 山 強 | 苫小牧東高校 | OUT | 04:08.37 | |
| 4 | 石 岡 守 | 吉田産業 | OUT | 04:10.10 | |
| 5 | 山 田 史 弥 | 日本大学 | IN | 04:10.19 | |
| 6 | 土 屋 直 人 | 山梨学院大学 | IN | 04:11.32 | |
| 7 | 荒 井 春 樹 | 法政大学 | IN | 04:12.76 | |
| 8 | 佐 藤 頌 | 日本体育大学 | OUT | 04:13.10 | |
| 9 | 及 川 一 也 | 専修大学 | IN | 04:13.18 | |
| 10 | 福 岡 裕 也 | 山梨学院大学 | OUT | 04:14.40 | |
| 11 | 竹 田 翔 平 | 駒大附属苫小牧高校 | IN | 04:14.54 | |
| 12 | 黒 坂 宏 哉 | 帯広ｽｹｰﾄ連盟 | OUT | 04:14.98 | |
| 13 | 清 水 孝 一 | 山梨学院大学 | OUT | 04:16.38 | |
| 14 | 赤 神 康 亮 | 釧路北陽高校 | IN | 04:18.55 | |
| 15 | 高 村 和 記 | 明治大学 | IN | 04:18.71 |