| 順位 | 選手名 | 所属名 | レーン | タイム | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 溜 井 公 子 | 岸本医科学研究所 | OUT | 00:40.23 | |
| 2 | 辻 麻 希 | 岸本医科学研究所 | OUT | 00:40.59 | |
| 3 | 河 田 智 子 | 信州大学 | IN | 00:40.98 | |
| 4 | 加治木 彩 | 八幡屋礒五郎 | OUT | 00:41.58 | |
| 5 | 堀 里 紗 | 富士急行 | IN | 00:41.60 | |
| 6 | 佐 藤 宝 | 秋田大学 | IN | 00:42.54 | |
| 7 | 佐々木 沙 綾 | 釧路北陽高校 | OUT | 00:42.85 | |
| 8 | 伊 藤 あさみ | 山梨学院大学 | IN | 00:42.90 | |
| 9 | 橋 本 亞 弥 | 駒大附属苫小牧高校 | OUT | 00:43.09 | |
| 10 | 黒 澤 文 恵 | 日本体育大学 | OUT | 00:43.29 | |
| 11 | 宮 﨑 麻 衣 | 嬬恋高校 | OUT | 00:43.61 | |
| 12 | 佐 藤 彩 香 | 池田高校 | IN | 00:43.99 | |
| 13 | 椙 浦 花梨子 | 日本体育大学 | IN | 00:44.93 |