| 順位 | 選手名 | 所属名 | レーン | タイム | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 安 田 直 樹 | たてしなクラブ | OUT | 04:13.08 | CR |
| 2 | 小 原 英 志 | 帝京第三高校 | IN | 04:13.34 | |
| 3 | 井 出 智 秀 | 専修大学 | IN | 04:15.13 | |
| 4 | 今 野 陽 太 | 専修大学 | IN | 04:17.94 | |
| 5 | 石 岡 守 | 吉田産業 | OUT | 04:19.16 | |
| 6 | 土 屋 直 人 | 山梨学院大学 | IN | 04:21.19 | |
| 7 | 及 川 一 也 | 釧路北陽高校 | OUT | 04:22.52 | |
| 8 | 藤 代 銀 司 | 明治大学 | OUT | 04:24.25 | |
| 9 | 松 倉 弘 明 | 航空自衛隊三沢 | IN | 04:26.15 | |
| 10 | 近 藤 邦 彦 | 本別高校 | IN | 04:27.66 | |
| 11 | 柴 田 正 隆 | 明治大学 | OUT | 04:31.58 |