| 順位 | 選手名 | 所属名 | レーン | タイム | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 松 岡 源 季 | 早稲田大学 | IN | 04:15.32 | |
| 2 | 深 萱 隆 司 | 信州大学 | OUT | 04:24.26 | |
| 3 | 矢 野 圭 祐 | 関東学院大学 | OUT | 04:32.11 | |
| 4 | 白 石 貴 明 | 関東学院大学 | IN | 04:32.70 | |
| 5 | 下屋敷 智 秀 | 早稲田大学 | IN | 04:33.41 | |
| 6 | 田 上 真 一 | 慶応義塾大学 | IN | 04:35.37 | |
| 7 | 竹 中 俊 輔 | 信州大学 | IN | 04:38.17 | |
| 8 | 古 川 智 一 | 筑波大学 | OUT | 05:02.56 | |
| 9 | 福 田 哲 也 | 都留文科大学 | OUT | 05:17.69 |