| 順位 | 選手名 | 所属名 | レーン | タイム | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 土 井 槙 悟 | 早稲田大学 | OUT | 04:15.85 | |
| 2 | 佐 藤 克 憲 | 法政大学 | IN | 04:17.73 | |
| 3 | 松 岡 源 季 | 早稲田大学 | IN | 04:27.83 | |
| 4 | 中 原 康 仁 | 慶應義塾大学 | IN | 04:45.95 | |
| 5 | 下 川 澄 人 | 盛岡大学 | IN | 04:52.21 | |
| 6 | 佐 藤 圭 悟 | 法政大学 | OUT | 04:56.66 | |
| 7 | 森 谷 茂 樹 | 東北大学 | OUT | 05:40.99 | |
| 8 | 大 手 伸 朗 | 都留文科大学 | OUT | 05:43.75 | |
| 9 | 水 尻 正 博 | 筑波大学 | IN | 05:53.39 | |
| 10 | 清 水 正 継 | 信州大学 | OUT | 05:53.74 | |
| 11 | 鹿 島 秀 一 | 東北大学 | OUT | 06:07.03 | |
| 12 | 福 田 哲 也 | 都留文科大学 | IN | 06:16.35 |