| 順位 | 選手名 | 所属名 | レーン | タイム | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 吉 田 真一郎 | 慶應義塾大学 | IN | 00:37.93 | |
| 2 | 松 本 徹 | 法政大学 | IN | 00:38.32 | |
| 3 | 小 嶋 雅 之 | 法政大学 | OUT | 00:39.27 | |
| 4 | 斉 藤 仁 | 仙台大学 | OUT | 00:40.20 | |
| 5 | 原 田 翔 史 | 仙台大学 | IN | 00:40.57 | |
| 6 | 石 関 祐 樹 | 早稲田大学 | OUT | 00:41.59 | |
| 7 | 下 居 広 泰 | 筑波大学 | IN | 00:43.59 | |
| 8 | 古 川 智 一 | 筑波大学 | OUT | 00:43.96 | |
| 9 | 千 葉 俊 一 | 国士舘大学 | IN | 00:44.34 | |
| 10 | 佐 藤 圭 祐 | 立教大学 | OUT | 00:44.87 | |
| 11 | 清 水 正 継 | 信州大学 | IN | 00:45.30 | |
| 12 | 江 口 洋 介 | 慶應義塾大学 | OUT | 00:45.58 | |
| 13 | 鹿 島 秀 一 | 東北大学 | OUT | 00:46.32 | |
| 14 | 日 塔 彬 | 東北大学 | IN | 00:49.14 | |
| 15 | 竹 中 俊 輔 | 信州大学 | IN | 00:53.69 |